麦考瑞大学教授领导CSIRO团队在疫苗竞赛中开发了一种新型的COVID-19分析

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2020年4月20
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麦考瑞大学生物医学科学系名誉副教授, 丹尼斯·鲍尔博士领导着来自CSIRO的一个生物信息学研究团队, 谁与病毒学家合作,揭示了一种分析遗传密码的新方法, 或蓝图, 导致COVID-19的SARS-CoV-2病毒.

这些发现将帮助研究人员更好地了解病毒株的进化过程,并识别出新的病毒簇.

对这种新型冠状病毒已发表的基因组序列的全球数据进行分析,将有助于加快我们对这种复杂疾病的了解.

研究人员开发了一种新的可视化平台, 基于最初用于分析人类基因组的生物信息学算法, 以确定SARS-CoV-2病毒数千个基因序列之间的差异.

鲍尔博士, 他也是CSIRO生物信息学团队的领导, 这篇论文的主要作者, 他说:“随着病毒的进化, 这一蓝图变得越来越重要, 事实上,因为它保存着关于病毒行为和它会导致哪种疾病的指示.”

鲍尔博士说:“在全球范围内,现在有大量的单个病毒序列。.

“评估这些数据点之间的进化距离并将其可视化,有助于研究人员发现病毒的不同毒株——包括它们来自哪里以及它们如何继续进化.”

CSIRO首席执行官拉里·马歇尔博士说,了解基因密码至关重要.

“我们对这种病毒了解得越多,我们就能更好地对抗它.”

“对SARS-CoV-2病毒基因组序列的这种高度复杂的分析已经帮助确定了适合的病毒毒株 用于测试的疫苗 正在位于吉隆的澳大利亚疾病预防中心进行,该中心是南半球唯一的同类生物控制设施,马歇尔博士说。.

作为研究的一部分,研究人员分析了来自当前COVID-19疫情的首批181个发表的基因组序列,以了解病毒的变化如何影响其行为和影响.

CSIRO表示,随着临床前和临床研究在研发疫苗方面的进展,这是监测的重要信息.

该研究团队呼吁国际研究界分享病例严重程度和结果的非识别细节, 以及其他相关元数据,如共病和吸烟状况, 和病毒的基因组序列一起.

这项工作显示了生物信息学的既有学科和新兴学科之间交叉合作的重要性, 基因组学, 疫苗和病毒学.

“数据可视化平台的优势在于,它突出了病毒在不断变化和适应新环境时不断进化的基因突变,鲍尔博士说。.

“我们对基因差异及其对疾病发展的可能后果了解得越多, 我们在诊断和治疗方面就能更好地应对这种疾病.”

同行评议的研究论文, “利用基因组学和生物信息学支持大流行应对:对新冠肺炎疫情的个案研究”, 已被 跨界和新发疾病 2020年4月7日发表.

可以找到新冠病毒基因组可视化平台 在这里.

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